В соответствии с Налоговым кодексом РФ (далее – НК РФ) налогоплательщиками налога на прибыль организаций (далее - налогоплательщики) признаются:
-российские организации;
-иностранные организации, осуществляющие свою деятельность в Российской Федерации через постоянные представительства и (или) получающие доходы от источников в Российской Федерации.

Следовательно, бюджетные и автономные учреждения, осуществляющие внебюджетную деятельность, являются налогоплательщиками. Есть определенные условия, виды учреждений, которые не платят налог на прибыль или у них установлена ставка 0%. Но далее речь пойдет не о них.

Итак, согласно НК РФ к доходам, не учитываемым при определении налоговой базы, относится имущество, полученного налогоплательщиком в рамках целевого финансирования. При этом налогоплательщики, получившие средства целевого финансирования, обязаны вести раздельный учет доходов/расходов, полученных/произведенных в рамках целевого финансирования. При отсутствии такого учета у налогоплательщика, получившего средства целевого финансирования, указанные средства рассматриваются как подлежащие налогообложению с даты их получения.

Раздельный учет доходов и расходов может быть организован с использованием:
- кодов видов деятельности (финансового обеспечения), которые используются при формировании номеров счетов бухгалтерского учета;
- дополнительных аналитических кодов (счетов).

Чаще всего учреждениями выбирается первый вариант учета. Казалось бы, все просто - необходимо корректно указывать код финансового обеспечения при постановке на учет доходов и расходов учреждения. Но часто здесь кроется подводный камень - иногда определенные расходы могут быть отнесены как к бюджетной, так и внебюджетной деятельности. Поэтому налоговые органы не всегда устраивает такой простой подход раздельного учета, необходимы отдельные расчеты для распределения расходов по бюджетной и внебюджетной деятельности.

Если ранее НК РФ была утверждена статья, которая регулировала признание доходов и расходов в бюджетных и автономных учреждениях, то теперь этот вопрос решается общими положениями 25 главы НК РФ.

Финансовое обеспечение выполнения государственного задания осуществляется в пределах бюджетных ассигнований, предусмотренных в бюджете на соответствующие цели.
Финансовое обеспечение выполнения государственного задания учреждениями осуществляется в виде субсидии. Размер такой субсидии рассчитывается на основании нормативных затрат на оказание государственных услуг и нормативных затрат на содержание имущества, закрепленного за учреждениями, а также на уплату налогов. При этом размер субсидии рассчитывается с учетом внебюджетных средств, планируемых к поступлению.

Согласно Постановлению Правительства РФ от 26 июня 2015 г. N 640 «О порядке формирования государственного задания на оказание государственных услуг (выполнение работ) в отношении федеральных государственных учреждений и финансового обеспечения выполнения государственного задания» «базовый норматив затрат на оказание государственной услуги состоит из базового норматива:
а) затрат, непосредственно связанных с оказанием государственной услуги;
б) затрат на общехозяйственные нужды на оказание государственной услуги.».

Если такие затраты, покрываемые за счет целевых средств, относятся и к деятельности, приносящей доход, и к деятельности по выполнению муниципального (государственного) задания, и при этом внебюджетная деятельность аналогична финансируемой за счет средств бюджета, во избежание спора с налоговым органом рекомендуем воспользоваться ст.272 НК РФ: «Расходы налогоплательщика, которые не могут быть непосредственно отнесены на затраты по конкретному виду деятельности, распределяются пропорционально доле соответствующего дохода в суммарном объеме всех доходов налогоплательщика». Т.е., если учреждение производит расходы, связанные как с деятельностью, осуществляемой в рамках целевого финансирования, так и с предпринимательской деятельностью, и при этом невозможно однозначно установить принадлежность таких расходов к бюджетной или внебюджетной деятельности, то скорее всего такие расходы налоговым органом не будут учтены в полном объеме при формировании налоговой базы по налогу на прибыль организаций. Следовательно, расходы необходимо распределить пропорционально доле соответствующего дохода в суммарном объеме всех доходов налогоплательщика. При этом расходы, взятые для определения налоговой базы, должны быть произведены учреждением для извлечения прибыли. При необходимости у учреждения должна иметься возможность документального подтверждения факта таких расходов.

Вы всегда можете обратиться за консультацией к нашим экспертам через систему «СоветникПРОФ» или по телефону горячей линии 8-800-700-3-705 (для Вас звонок бесплатный по РФ)